KARAKTERISASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI ENDOFIT ASAL AKAR TANAMAN BAWANG MERAH (Allium cepa L.) DENGAN SISTEM AKUAPONIK SEBAGAI PEMACU PERTUMBUHAN TANAMAN

Kolonisasi bakteri endofit pada jaringan akar tanaman bawang merah
berkontribusi terhadap pertumbuhan tanaman. Bakteri endofit mampu
menghasilkan hormon Indole Acetic Acid (IAA), menambatkan Nitrogen,
melarutkan Fosfat, dan melarutkan Kalium. Tanaman bawang merah dengan
sistem akuaponik memanfaatkan kotoran ikan yang kaya akan unsur hara Fosfat,
Nitrogen, dan Kalium sebagai nutrisi tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk
mengkarakterisasi dan mengidentifikasi bakteri endofit asal akar tanaman bawang
merah (Allium cepa L.) dengan sistem akuaponik sebagai pemacu pertumbuhan
tanaman.
Sampel akar tanaman bawang merah yang dibudidayakan pada sistem
akuaponik diperoleh dari green house Badan Riset dan Inovasi Nasional (BRIN)
Cibinong, Bogor dengan empat perlakuan pemberian POC kasgot yang berbeda.
Bakteri endofit diisolasi dari akar tanaman bawang merah dengan sterilisasi
permukaan yang selanjutnya dikultur pada media Nutrient Agar (NA).
Karakterisasi bakteri endofit akar tanaman bawang merah sebagai pemacu
pertumbuhan tanaman dilakukan melalui uji penghasil hormon IAA, uji
penambatan Nitrogen, uji pelarutan Fosfat, dan uji pelarutan Kalium. Bakteri
endofit yang terseleksi memiliki potensi sebagai pemacu pertumbuhan tanaman
dilakukan identifikasi morfologi dan molekuler menggunakan analisis
sekuensing gen 16S rRNA.
Jumlah koloni tunggal dari hasil isolasi bakteri endofit diperoleh sebanyak
24 isolat. Hasil karakterisasi menunjukkan bahwa terdapat dua isolat bakteri
endofit yang terseleksi memiliki potensi sebagai pemacu pertumbuhan tanaman
yaitu isolat P1A4 dan P2A1.1. Berdasarkan identifikasi morfologi secara
makroskopis, isolat P1A4 dan P2A1.1 memiliki morfologi koloni berbentuk
circular, tepian entire, elevasi convex, dan warna koloni putih. Berdasarkan
identifikasi morfologi secara mikroskopis, isolat P1A4 dan P2A1.1 tergolong
kelompok bakteri Gram negatif dengan bentuk sel bacillus. Identifikasi molekuler
menggunakan analisis sekuensing gen 16S rRNA menunjukkan bahwa isolat
P1A4 memiliki kemiripan dan berkerabat dekat dengan genus Klebsiella
penumoniae strain DSM 30104, sedangkan isolat P2A1.1 memiliki kemiripan dan
berkerabat dekat dengan genus Klebsiella quasivariicola strain KPN1705.